El museo tiene como misión ofrecer a docentes y estudiantes de los niveles iniciales primarios y medio, contenidos lúdicos educativos que destaquen las virtudes de la odontología como disciplina científica, y promocionen la importancia de la salud bucal.

Para favorecer los procesos de enseñanza/aprendizaje, se trabaja articuladamente con estudiantes, docentes e investigadores, con el objetivo de generar diversas propuestas educativas adaptadas a las necesidades y particularidades de cada nivel.